MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56A

Total Repeats: 1099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017483	AAT	2	6	60	65	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017483	GTC	2	6	165	170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017483	GTTT	2	8	256	263	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017483	TCAAT	2	10	461	470	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017483	A	7	7	510	516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017483	A	7	7	518	524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017483	AT	4	8	548	555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017483	A	8	8	580	587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017483	A	6	6	626	631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017483	A	6	6	648	653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017483	A	6	6	670	675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017483	ATA	2	6	724	729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017483	TCT	2	6	758	763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017483	A	6	6	817	822	100 %	0 %	0 %	0 %	385831892
15	NC_017483	GT	3	6	848	853	0 %	50 %	50 %	0 %	385831892
16	NC_017483	GAAA	2	8	859	866	75 %	0 %	25 %	0 %	385831892
17	NC_017483	TTG	2	6	882	887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831892
18	NC_017483	ATTT	2	8	998	1005	25 %	75 %	0 %	0 %	385831892
19	NC_017483	AGA	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831892
20	NC_017483	T	7	7	1027	1033	0 %	100 %	0 %	0 %	385831892
21	NC_017483	AAG	2	6	1068	1073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831892
22	NC_017483	T	6	6	1100	1105	0 %	100 %	0 %	0 %	385831892
23	NC_017483	A	6	6	1120	1125	100 %	0 %	0 %	0 %	385831892
24	NC_017483	TAC	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831892
25	NC_017483	GGAC	2	8	1173	1180	25 %	0 %	50 %	25 %	385831892
26	NC_017483	AGTA	2	8	1289	1296	50 %	25 %	25 %	0 %	385831892
27	NC_017483	A	7	7	1486	1492	100 %	0 %	0 %	0 %	385831892
28	NC_017483	GAA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831892
29	NC_017483	GAA	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831892
30	NC_017483	GAT	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831892
31	NC_017483	GAC	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831892
32	NC_017483	A	6	6	1649	1654	100 %	0 %	0 %	0 %	385831892
33	NC_017483	AGA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831892
34	NC_017483	TTA	2	6	1718	1723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831892
35	NC_017483	AAG	2	6	1872	1877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831892
36	NC_017483	A	6	6	1910	1915	100 %	0 %	0 %	0 %	385831892
37	NC_017483	GAA	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
38	NC_017483	ACAAA	2	10	2025	2034	80 %	0 %	0 %	20 %	385831893
39	NC_017483	A	7	7	2045	2051	100 %	0 %	0 %	0 %	385831893
40	NC_017483	TATC	2	8	2063	2070	25 %	50 %	0 %	25 %	385831893
41	NC_017483	A	7	7	2080	2086	100 %	0 %	0 %	0 %	385831893
42	NC_017483	A	6	6	2094	2099	100 %	0 %	0 %	0 %	385831893
43	NC_017483	TAT	2	6	2108	2113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831893
44	NC_017483	AACA	2	8	2123	2130	75 %	0 %	0 %	25 %	385831893
45	NC_017483	TAA	2	6	2132	2137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831893
46	NC_017483	AGA	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
47	NC_017483	AAG	2	6	2168	2173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
48	NC_017483	AGA	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
49	NC_017483	AAG	2	6	2201	2206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
50	NC_017483	AGA	2	6	2223	2228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
51	NC_017483	AAG	2	6	2234	2239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
52	NC_017483	AGA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
53	NC_017483	AAG	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
54	NC_017483	AGA	2	6	2289	2294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
55	NC_017483	AAG	2	6	2300	2305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
56	NC_017483	AGA	2	6	2322	2327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
57	NC_017483	AAG	2	6	2333	2338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
58	NC_017483	AGA	2	6	2355	2360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
59	NC_017483	AAG	2	6	2366	2371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
60	NC_017483	AGA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
61	NC_017483	AAG	2	6	2399	2404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
62	NC_017483	AAAG	2	8	2425	2432	75 %	0 %	25 %	0 %	385831893
63	NC_017483	AACA	2	8	2465	2472	75 %	0 %	0 %	25 %	385831893
64	NC_017483	A	8	8	2487	2494	100 %	0 %	0 %	0 %	385831893
65	NC_017483	CAA	2	6	2500	2505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831893
66	NC_017483	CAA	3	9	2524	2532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831893
67	NC_017483	A	6	6	2551	2556	100 %	0 %	0 %	0 %	385831893
68	NC_017483	AGA	2	6	2562	2567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
69	NC_017483	GGA	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831893
70	NC_017483	TCG	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831893
71	NC_017483	GAA	2	6	2656	2661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
72	NC_017483	AGA	3	9	2694	2702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
73	NC_017483	AAAAGA	2	12	2715	2726	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385831893
74	NC_017483	A	6	6	2746	2751	100 %	0 %	0 %	0 %	385831893
75	NC_017483	TGG	2	6	2752	2757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831893
76	NC_017483	GAA	2	6	2765	2770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831893
77	NC_017483	TA	3	6	2779	2784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017483	T	7	7	2797	2803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017483	GGA	2	6	2813	2818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017483	GAC	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831894
81	NC_017483	ATTA	2	8	2838	2845	50 %	50 %	0 %	0 %	385831894
82	NC_017483	CAA	2	6	2863	2868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831894
83	NC_017483	ATGG	2	8	2892	2899	25 %	25 %	50 %	0 %	385831894
84	NC_017483	A	8	8	2901	2908	100 %	0 %	0 %	0 %	385831894
85	NC_017483	AAGC	2	8	2929	2936	50 %	0 %	25 %	25 %	385831894
86	NC_017483	CTG	3	9	2969	2977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831894
87	NC_017483	ATT	2	6	3066	3071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831894
88	NC_017483	GCTC	2	8	3124	3131	0 %	25 %	25 %	50 %	385831894
89	NC_017483	A	7	7	3164	3170	100 %	0 %	0 %	0 %	385831894
90	NC_017483	AAC	2	6	3179	3184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831894
91	NC_017483	TA	3	6	3203	3208	50 %	50 %	0 %	0 %	385831894
92	NC_017483	TA	3	6	3220	3225	50 %	50 %	0 %	0 %	385831894
93	NC_017483	AATG	2	8	3298	3305	50 %	25 %	25 %	0 %	385831894
94	NC_017483	A	6	6	3307	3312	100 %	0 %	0 %	0 %	385831894
95	NC_017483	TAG	2	6	3324	3329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831894
96	NC_017483	A	6	6	3338	3343	100 %	0 %	0 %	0 %	385831894
97	NC_017483	GAA	2	6	3376	3381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831894
98	NC_017483	TGA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831894
99	NC_017483	GAT	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831894
100	NC_017483	ATA	2	6	3475	3480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831894
101	NC_017483	AT	3	6	3493	3498	50 %	50 %	0 %	0 %	385831894
102	NC_017483	GAT	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831894
103	NC_017483	ATT	2	6	3562	3567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
104	NC_017483	A	7	7	3588	3594	100 %	0 %	0 %	0 %	385831895
105	NC_017483	TAT	2	6	3687	3692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
106	NC_017483	ATT	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
107	NC_017483	CAG	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831895
108	NC_017483	AATT	2	8	3975	3982	50 %	50 %	0 %	0 %	385831895
109	NC_017483	A	6	6	4038	4043	100 %	0 %	0 %	0 %	385831895
110	NC_017483	TGA	3	9	4063	4071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
111	NC_017483	AATC	2	8	4129	4136	50 %	25 %	0 %	25 %	385831895
112	NC_017483	AT	3	6	4138	4143	50 %	50 %	0 %	0 %	385831895
113	NC_017483	A	6	6	4193	4198	100 %	0 %	0 %	0 %	385831895
114	NC_017483	TCATGA	2	12	4216	4227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385831895
115	NC_017483	AAG	2	6	4338	4343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
116	NC_017483	A	6	6	4425	4430	100 %	0 %	0 %	0 %	385831895
117	NC_017483	A	6	6	4435	4440	100 %	0 %	0 %	0 %	385831895
118	NC_017483	A	8	8	4445	4452	100 %	0 %	0 %	0 %	385831895
119	NC_017483	TGA	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
120	NC_017483	AAGATG	2	12	4595	4606	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385831895
121	NC_017483	AGA	2	6	4633	4638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
122	NC_017483	ATTT	2	8	4681	4688	25 %	75 %	0 %	0 %	385831895
123	NC_017483	TGG	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831895
124	NC_017483	TGA	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
125	NC_017483	ACA	2	6	4842	4847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831895
126	NC_017483	GAT	2	6	5051	5056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
127	NC_017483	TGAA	2	8	5091	5098	50 %	25 %	25 %	0 %	385831895
128	NC_017483	ATA	2	6	5142	5147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831895
129	NC_017483	TTA	2	6	5225	5230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831895
130	NC_017483	AAG	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
131	NC_017483	TGT	2	6	5311	5316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831895
132	NC_017483	GAT	2	6	5321	5326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
133	NC_017483	CAA	2	6	5349	5354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831895
134	NC_017483	GAA	3	9	5560	5568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
135	NC_017483	AATT	2	8	5629	5636	50 %	50 %	0 %	0 %	385831895
136	NC_017483	ACA	2	6	5662	5667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831895
137	NC_017483	AAG	2	6	5670	5675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831895
138	NC_017483	A	6	6	5768	5773	100 %	0 %	0 %	0 %	385831895
139	NC_017483	GTTC	2	8	5792	5799	0 %	50 %	25 %	25 %	385831895
140	NC_017483	ATG	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831895
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272	NC_017483	T	6	6	11088	11093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017483	TCC	2	6	11117	11122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_017483	T	6	6	11185	11190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017483	TAT	2	6	11203	11208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_017483	TGA	2	6	11293	11298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831899
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